殺菌劑MicroTreat™ BIO可以按照如下三種方法使用。
1. 連續投加式
將MicroTreat™ BIO注入到保安過濾器前， 使用劑量為1-5ppm。
2. 間歇連續式
間歇連續周期注入，根據系統狀態和反滲透進水水質，每班或者每天，以至每周注入一次，每次1-2小時。這樣可以降低運行費用，同時可以很好的控制細菌的孳生， 使用劑量為3-5ppm。
3. 沖擊式
將MicroTreat™ BIO按1%濃度配制成殺菌劑溶液（對于醋酸纖維素膜，應用硫酸或鹽酸將溶液pH值調至4-6），用低壓泵打入系統，浸泡60分鐘；如系統污染嚴重，應延長浸泡時間。然后用反滲透產品水或除鹽水沖洗15分鐘；對于污染嚴重的系統，還可以將MicroTreat™ BIO按20%濃度配制成殺菌劑，低壓循環沖洗，時間不少于60分鐘。（此方法不適用于醋酸纖維素膜）。

注：在使用MicroTreat™ BIO浸泡之前，應先用酸洗，以去除膜表面上可能存在的金屬氧化物。浸泡后，用堿洗（推薦使用清力公司的清洗劑Diamite BFT），去除生物體的尸體及有機殘渣。